主要从事思维科学等方面的研究，主要作品有《科技革命的步伐》、《思维的历程》、《20世纪科学发现纵横谈》，《珍惜我们的家园》，《认识自我》、《开发自我》、《人生的智慧》等50余种，撰写《科学智慧》电视片40余集。其作品《月球上的足迹》被选入全国中学语文课本第7册。
此外还发表论文100多篇，文章1000多篇。 朱长超的主要论文有发表于《哲学研究》等刊物的《论人类思维的起源是个自然历史过程》，《论用比较法研究意识起源的过程》，《论人类思维起源的动力》，《论人类思维发展的起点》等。他关于人类思维发展趋势的论文、关于社会生物学的论文，曾得到一些著名学者的良好评价。
其著作和论文曾获得许多个奖项。其中《创新思维》获全国思维科学学会（筹）特等奖，＜思维史研究初探＞获得院优秀论文奖，发表于红旗杂志的《评社会生物学及人性自私论》获院优秀论文奖，思维不宜过分精致获市宣传部二等奖，＜思维史研究的方法＞获得思维科学10周年研讨会优秀论文一等奖，《挖掘大脑中的财富》被评为2001年最受读者欢迎的图书之一，获得国家自然科学基金会、中国作协、中国科协、新闻出版总署优秀著作三等奖。
朱长超性格温和而坚定，富有幽默感，同理心，热爱自然，热爱生活，热爱真理，人生格言是：多向世界说真话，勤为后人著文章。他曾经烧过5年大炉，当过多年“516”分子，曾跋涉过人生的沼泽地，也曾徘徊于孤独的无助之境，深知灵魂痛苦的滋味，愿以赤诚之心和科学的理念帮助求助的朋友尽早走出心灵的泥沼，恢复心灵的自由和健康，让健康的心灵在鲜花丛中自由飞翔
