1991年宪法规定，司法权独立于立法权和行政权。总统保证司法的独立性，并主持最高司法会议。政府设有司法部，最高法院成员由国民议会和参议院在各自的议员中选出同等数目成员组成，院长由其成员推举产生。毛司法机构由最高法院、特别法院、上诉法院、刑事法庭、轻罪法庭、违警罪法庭、劳工法院、省级法院、县级法院组成。1980年建立伊斯兰法庭，实行伊斯兰法。2005年8月政变后，军政权宣布保留最高法官委员会、法院和法庭，重新确定宪法委员会的权限。最高法院院长为穆罕默德·戴·乌尔德·哈纳尼（MOHAMED DE OULD HANANA）。最高法院总检察长利马姆·乌尔德·特盖迪（LIMAME OULD TEGUEDI）

独立后建立国民军，指挥官多为法国人。1965年开始启用本国军官，至1973年指挥官全部由本国军官担任。实行义务兵（二年）和志愿兵相结合的兵役制度。总统任武装部队统帅，主持国防会议和最高委员会。国防部设有陆、海、空三军，自1995年起国防部长由文官担任，陆军由国民军参谋长直接管辖。全国有6个军区，4所军、警、宪学校。2003年三军总兵力15750人，其中陆军15000人，编有步兵营４个、炮兵营１个、装甲侦察中队１个、高炮连４个、工兵营１个；海军500人；空军250人。另有宪兵3000人，国民卫队2000人。2004年军费开支为2076.9万美元，占国内生产总值1.6%。