1950年,白崇禧任“总统府”战略顾问委员会副主任,并以国民党执行委员身份参加负责台湾党务改组工作的一个委员会。
1952年的一天,白崇禧和薛岳两人的家,被蒋经国派人去检查。白的家被检查人员翻箱倒箧,连地板都被撬开搜查过,搜走不少黄金和美钞。白打电话质问蒋经国时,蒋经国说:“并非我的意思,你们打电话问总统好了。”白、薛又打电话给蒋介石,得到的答复是:“知道此事,不仅对你们两人如此,人人都应该这样来一次。”实际上,只对白、薛两家如此。此后,每当台湾当局开会攻击李宗仁时,他就赶紧随声附和一通。1954年3月10日,台湾“第一届国民大会第六次会议”罢免李宗仁的“副总统”职时,白竟高高举起双手,表示赞成,唯恐对蒋不忠。
1964年,当李宗仁在美国纽约发表公开信,劝告美国效法戴高乐政府时,在台北息影多年的白崇禧于3月18日致电李宗仁,云:“总统蒋公率全国军民,尝胆卧薪,生聚教训,正在待机执戈西指,完成反攻复国大业。而我公旅居海外,迭发谬论,危及邦家,为亲痛仇快。最近阅报,法国与共匪建交之后,我公宽于2月12日投函纽约前锋论坛报,公然支持共匪,劝说美国学步法国,与共匪调整关系。我公对国难既不能共赴,反为共匪张目,危害国家,是诚何心,是真自毁立场矣!自绝于国人矣!伏望我公激发良知,远离宵小,翻然悔悟,以全晚节。”
自1963年2月开始,白崇禧接受台湾中央研究院近代史研究所采访,直至去世前八天止,被先后访问一百二十八次。其谈话内容被整理陆续发表于香港《中报》月刊1980至1985年间。南昌陆军学院又将《中报》五年多来的连载资料编纂成《白崇禧回忆录》一书,并由解放军出版社于1987年5月出版,次年又再版。
1966年12月2日,白崇禧因心脏病在台北去世,终年七十四岁。时遗有子女十人(七男三女)。五子白先勇是台湾著名作家。