《游击战纲要》一书共分十四部分：(一)组织：以灵活严密，便于进退集散，给养补充，能担负独立任务为准。(二)根据地：为我机动战之策源地，持久战之堡垒，目的使部队获得整顿与补充。应创立主根据地、副根据地、预根据地和假根据地。(三)政治工作：应使官兵明了大义，增强民众与军队切实合作，岚难与共，瓦解敌军。(四)战斗：常以少数兵力，劣势装备，以求达成任务，主要在敌后行之，达成扰乱、破坏、牵制、消耗敌实力之目的，以造机、补机、伺机打击敌人为本旨，以攻势为通常战斗样式，力求进退自如，以袭击、伏击、夜袭，以柔克刚为主要手段等。(五)命令、通报、报告。(六)侦察。(七)警戒。(八)行军：以轻装、迅速、秘密为要。(九)宿营：应时常变换位置。(十)通信联络。(十一)破坏。(十二)补给、给养。(十三)卫生。 (十四)阵中日记。该书特别强调游击队应有自觉之纪律、自治之能力、自动之精神和尽忠职守、临机应变、独断专行，主张融军事与政治、军队与民众、意志与识见于一体。

    白崇禧在抗战胜利之初，著有《现代陆军军事教育之趋势》一书。该书总结了他当八年副参谋总长兼军训部长视察学校与部队所得意见。该书分四大部分阐述：(一)概论，(二)军事教育之先决条件，(三)战场需要决定军事教育之内容；(四)基本教育。白崇禧在书中总结说：“为将之道，要能带兵，要能练兵，要能用兵。开诚布公，信赏惩罚，此带兵之道；技艺纯熟，指臂相使，此练兵之道，运用之妙，存乎一心，此为用兵之道。……有主义之军队，若人身之灵魂，常能愈挫愈奋，愈战愈勇，不避艰险，一往直前。”该书分析了两次世界大战的特点，阐述了“生产工具决定战斗工具，生产技术决定战斗技术”，“平面战术，演变为立体战术，立体战术演变为闪电战术，将来可能演变为按钮战术，时代既为科学时代，战争自为科学战争，故军队几乎全部科学化技术化”，“战争之关键，不全在武器，而仍在人之因素。人必须加以严格之训练，始可使用现代装备，发挥威力，若训练不精，装备等于零”等学术观点。他认为政治、经济、文化是军事教育之先决条件。“政治与军事之配合，政略与战略之一致，此为千古不易之原则。”生产能力与生产技术之水准，关系军事教育甚大，若教育器材缺乏，武器陈旧，岂能训练出精良优秀之干部?”“凡军事教育有成绩之国家，在文化上必有其得天独厚之条件。例如：有以民主自由为招牌，有以种族犹越为号召，有以天皇为偶象，有以阶级利益为招徕，口号虽有不同，皆要以国民教育为基础。”他主张军事教育要从现代战场实际需要出发，而非万能之教育。他说：“所谓军事教育，是养成提高指挥战斗与遂行战斗诸种能力所实施之一种教育。其目的在求战场上之胜利。”“现代教育之趋势，首应注视现代战场之需要。”其基本教育之重点是突出“体格之锻炼，精神之陶冶，基本武器之使用，判断与决心迅速，行动敏捷；兵种协调和各种天候地形作战”。

    1946年6月1日，陆军部改为国防部，白崇禧任国防部长，陈诚为总参谋长。

    1947年，台湾“二·二八事件”爆发后，白崇禧受蒋介石之命，于3月17日飞抵台湾，处理善后事宜。他到台后，宣布了处理事变的四原则，平息了危机，白返南京后：蒋拟以白任张群内阁的副院长仍兼国防部长以酬其功，但白力辞。是年11月10日，蒋召见白崇禧，要他在九江设立国防部长指挥所，以对抗大别山区的刘邓大军。11月中旬，国防部长九江指挥所正式成立。这是白自任国防部长以来蒋首次给他以部队的指挥权。