蒙元帝国，耗时二十七年，七次征讨，才使高丽臣服，成为元之东藩。两国关系之密切更甚与唐与新罗的“特殊国与国的关系”。世祖时，高丽忠烈王迎娶世祖女齐国长公主为妃，高丽成为元之驸马国，忠烈王更下令高丽全国穿蒙古服，留蒙古发髻。此后两国世代联姻，至高丽恭愍王七代均为元之驸马。高丽世子更作为吐鲁花（人质）居住大都，继承王位后，也经常往来大都。更有高丽世子在居留大都时，参与元宫政争。

元之王公贵族乃至皇帝，多人聘娶高丽女子，其中最为有名的就是顺帝皇后完者忽都，足见两国关系之非同一般。元设立征东行中书省管理高丽，，以高丽国王世为中书省左丞相，但中书省平章事由元帝国任命，并在高丽各地派驻达鲁花赤，可见高丽虽有一定的独立性，但始终在元的控制之下。