宪法规定由最高法院、上诉法院、初审法庭、治安裁判所行使司法权。最高法院是最高司法机构，包括司法法庭、行政法庭和财政法庭，由16名成员组成，院长由总统征求参众两院议长意见后以法令形式任命。最高法院法官实行终身制。此外还设有宪法委员会，负责审查法律、协定等是否违宪，并监督、审理、公布选举及公民投票结果。设立特别最高法庭负责审判总统、政府成员及其同谋的叛国案。最高法院院长阿布戴拉希姆·布雷梅·哈米德（Abderahim BIREME HAMID）。总检察长恩加何达·姆贝阿乌鲁姆·爱德华（Ngarta Mbaiaouroum EDOUARD）。

1991年1月代比总统颁布命令将全国武装部队改编为乍得国民军。全国共划分为八个军区。实行义务兵役制，服役期一年半。1991年7月，乍得同法国签订了帮助乍缩编军队协议。2001年，乍总兵力34850人，其中陆军约25000人，空军350人，宪兵4500人，共和卫队5000人。 总统代比中将为最高军事统帅。三军总参谋长哈桑·乔鲁博准将（Hassan DJOROUBO）。