10月2日，迪化市各族人民在和平广场载歌载舞，欢庆新中国诞生、新疆和平解放。陶峙岳发表了演说。然而一小撮反动分子却不断策划和制造反革命暴乱，街上常会响起断断续续的枪声，出现一些反动分子的标语，新疆局势仍然动荡不安。迪化市内更是谣言频起，危机四伏。陶峙岳的心刚为新疆和平解放而欣慰，这时又压上了沉重的石头，他彻夜难眠。陶峙岳四处奔走，亲自下部队作报告，分析新疆形势、国内形势，宣传共产党和解放军的政策，说明起义的种种理由，逐步稳定了军心。但由于新疆地域辽阔，部队驻地分散，骚乱事件仍
时时发生。
为了进一步稳定局面，10月5日，陶峙岳亲自到酒泉会见了彭德怀和王震，受到他们热情欢迎，陶峙岳感叹地说：“我做梦都在想解放军早日进疆啊！”陶峙岳在酒泉还参加了第1兵团的常委扩大会，参观了中国人民解放军的军容。对解放军艰苦朴素的作风留下深刻的印象。尤其是彭德怀派人保护他远在四川的亲属，使他深为感动。他和彭德怀、王震还深谈了部队整编和改造、解放军入疆和组建军政委员会等问题，三个湖南老乡相见甚欢。不久，王震指挥部队进疆，陶峙岳万分激动，挥毫写下了《七绝·迎王震将军入疆》：“将军谈笑指天山，便引春风渡玉关，绝漠红旗招展处，壶浆相迎尽开颜。”
12月7日，新生的新疆军区正式成立。彭德怀任司令员，王震、陶峙岳等人任副司令员。19日，起义部队正式开始集中整编。陶峙岳以起义部队最高指挥官的名义，发布了《为整编部队告起义将士书》，要求全体起义官兵根据新政府共同纲领中关于军事制度的精神，在中央人民政府、人民革命军事委员会的领导下，实行统一指挥、统一制度、统一编制、统一纪律。
1949年12月30日，新疆起义部队改编为中国人民解放军第22兵团，陶峙岳任兵团司令员，王震任政治委员。从此，陶峙岳根据中共中央指示，认真做好部队官兵的思想政治工作，整顿作风，严格纪律，平息叛乱，维持社会秩序。同时，大力组织和发展生产，稳定了新疆的局势。起义前，陶峙岳曾和赵锡光相约，将部队交给解放军后，即解甲归田。解放后，在共产党大公无私精神的感召下，他打消了引退之意，决心做些有益于人民的事情。
1950年2月，陶峙岳赴北京汇报工作，受到毛泽东的亲切接见。他向毛泽东简要汇报了新疆的工作情况，毛泽东非常满意，并作出了对新疆工作的指示。毛泽东还请他共进晚餐，席间没有大鱼大肉，山珍海味，只有几样湖南家乡菜，使陶峙岳备感亲切。毛泽东和他直谈到深夜，不仅谈了国家大事，还谈到陶峙岳的家庭等。毛泽东还诚恳地勉励陶峙岳：“要好好学习，自我改造，过好三关。第一关是解放战争关，现已过去，过得很好。第二是土地改革关，不久就要过去。第三是社会主义关，现在还没有开始，要有思想准备。”陶峙岳当时并不完全理解。但他确信，只要跟着共产党走、什么关都会过去的。以后每次赴京开会，毛泽东都会紧紧握着他的手，称他“陶将军”。通过与彭德怀、王震、毛泽东、周恩来、贺龙等人的接触，陶峙岳深深感到共产党人待人真诚，肝胆相照，不谋私利，生活简朴，他的内心更生崇敬，更加坚定了跟着党走，与人民的事业荣辱与共的坚定信念。
1950年，按照毛泽东关于军队参加生产建设工作
