新宪法规定：司法权独立于立法权，不得侵犯行政或立法权权限；司法权由最高法院、审计和预算法院、上述法院和其他各级法院行使；共和国总统主持最高司法会议，通过其确保司法权独立；最高法院成员和其他各级法院的法官由总统根据最高司法会议的提名任命；设立宪法法院，负责监督各项法律及国际条约和协定符合宪法规定；设立特别法庭，负责审理总统犯有的叛国罪和议员及政府成员履行职权过程中的犯罪事实。最高法院院长普拉西德·朗加（Placide Lenga）；宪法法院院长热拉尔·比钦杜（Gérard Bitsindou）；总检察长乔治·阿基耶拉（Georges Akiera）。

独立后组建军队，称“刚果武装部队”。1966年6月22日，改为“刚果国家人民军”，6月22日定为建军节。1992年3月15日通过的宪法恢复“刚果武装部队”名称。1997年10月颁布的《过渡期基本法》规定，共和国总统是军队最高统帅，在内阁会议上任命军事高级职位，根据法律规定军事职责。2002年底，萨苏总统对刚军结构做出重大调整，设立副总参谋长、三军和国家宪兵总督察，取消陆、海、空军司令，分设陆、海、空军参谋长。同时任命夏尔·理查德·蒙乔少将（Charles Richard MONDJO）为总参谋长。 实行义务兵役制，18～35岁的公民必须义务服兵役两年。2002年总兵力25000人，其中陆军14500人，海军1500人，空军2000人，宪兵2000人，国家警察等准军事人员5000人。