有最高法院、刑事法院、区级法院、宗教法院（希族）和家庭事务法院（土族）。最高司法理事会由共和国总检察长和最高法院院长及法官组成。最高法院院长乔吉奥斯·佩基斯（Georgios Pikis）。总检察长阿莱克斯·马尔基迪斯（Alecos Markides）。

国民警卫队为塞政府的武装力量，建于1964年。司令和一些高级军官由希腊军官担任。现任司令为万杰洛斯·弗洛拉基斯中将。实行义务兵役制，服役期为26个月。总兵力13000人(1999年)，有机械化侦察营3个，步兵营18个，突击队2个，炮兵连6个，辅助分队8个。另有警察部队3700人。2002年，塞国防支出为3.7亿美元，占国内生产总值4.2%。希腊在塞驻军1250人；土耳其驻军3.6万人；英国在塞有两个军事基地，驻军约3700人；联合国维持和平部队1223人，34名民警。土族常规部队“保安旅”有5000人，编为7个步兵营和1个装甲连，另外还有武装警察部队1853人。