1944年4月30日，严老师病逝于恩施沙湾湖北省立医院，病中，他多次要求医生勿为他的病多费精力，更不要为治他一人之病而影响其他患病群众的治疗，情辞恳切，闻者莫不感动。弥留之际，侍病在旁的贺有年，问严先生有无遗嘱，他睁眼点头，表示有话要说，但已话不成声。贺执笔铺纸，只记下：“有罪要火葬”五个字。“有罪要火葬”遗言虽仅五字，正表明他对祖国、对人民的高度责任感，也包含着他对时局的忧虑和悲愤。
严先生与世长辞后，恩施各界举行追悼会，董必武从重庆寄去了一副挽联，联云：
贻我一篇书，语重心长，自探立国千年奥
奠君三爵酒，形疏礼薄，难诉回肠九曲深
严先生身后家境萧条，生养死葬都成问题。万耀煌任湖北省主席时，把他的遗体运回武汉，移葬于武昌郊区九峰山，与石瑛先生葬在一起。粉碎“四人帮”后，湖北省人民政府曾重修此墓。
