1966年2月 调至四川大渡河龚咀水电站工地，任水电总局工作组成员，协助成都勘测设计院进行龚咀水电站的设计工作。大渡河是金沙江又一水力资源丰富的大支流。在工地上他与成都院的同志融为一体，在枢纽布置、导流、围堰、坝内厂房等问题上提出许多建议。研究大孔口重力坝的分析问题。

1966年6月～ “文化大革命”，回上海接受批判。其中初期担任过永安水电站设计及1970年5月 研究工作，提出用“弹性力学问题的交互分析法”解决大孔口坝段的应力分析问题。1967年起入“牛棚”劳改。1970年5月恢复工作。

1970年5月～ 回四川锦屏参加磨房沟水电站设计、施工工作。1972年电站投产。磨房沟水电站是锦屏水电站的施工电站，有当时水头最高的明钢管和球叉，该电站工地受“文革”武斗破坏，濒临解体下马。第七届军管会的进驻和设计组的到来，使电站起死回生。经一年多的努力即投产，成为西昌地区的主力电站。潘家挣还完成了“构架式发电机支域”、“球叉”等研究工作。1972年奉命回浙江查勘巨江紧水滩、小溪和飞云江水力资源，提出开发规划。

1972年12月～ 参加水利电力部乌江渡工作组，研究解决乌江渡工程中的问题。乌江渡水电站是开发乌江的关键工程，坝高165m，建于岩溶地基上。开工后由于地质条件比预计的要差，且受“文革”影响，施工质量发生问题，有下马或降低坝高之议。潘家挣等专家经深入调研，慷慨陈词，力主按原设计复工，并提出具体措施。会后，乌江渡水电站得顺利复工，胜利建成。通过乌江渡工程，潘家铮院土与中南勘测设计院的同志建立了深厚的友谊。之后在该院讲课，内容有“随机振动理论”、“大规模线性方程的求解”、“有限元形态”、“空间有限元分析”等，把有限元法和随机分析介绍到水工设计中来。

1973年3月～ 借调至北京水利电力部对外司任工程师，在此期间担任过以下任务：

1978年3月 审查各援外工程设计（阿尔巴尼亚菲尔泽水电站、喀麦隆拉格都水电站、刚果布昂札水电站、马里姆巴拉利水利工程……）；参加有关中外会谈。协助基建司审查国内务水电工程。

较重要的活动有：

出席1973年4月安康水电站复审会议，任水工组长，根据新发现的地质情况，决定移动坝线（陕西）。

·出席1973年11月乌江渡水电站灌浆、地基处理问题（贵州）。

·1974年4月参加固县水库设计审查（河南）。

·1974年10月参加白山水电站设计审查（吉林）。

·1975年6月参加枫树坝及泉水工程研究（广东）。

·1975年9月主持新安江工程鉴定（浙江）。

·1975年12月审定水工钢筋混凝土设计规范。

·1975年去阿尔巴尼亚审查菲尔泽水电站设计。主要研究土坝和库区内布拉瓦大滑坡的稳定问题。关于滑坡稳定，他在50年代初就接触这类问题，在70年代结合布拉瓦问题，开展了系统研究，归纳整理了各种分析方法，研究其本质问题，提出两项基本原理，并推导了许多计算方法。还研究了滑坡引起的水库涌浪，推导其估算公式。与孙君实同志合作，开发用计算机寻化原理分析任意滑坡稳定的问题。他还结合菲尔泽工程取消调压井问题研究水轮机小波稳定，提出了理论和数值分析方法。

·1976年去喀麦隆审查拉格都水电站设计。主要研究滩地软土的固结问题。他澄清了对固结定义的一些误解，推导了砂井固结作用公式，增强了解决问题的信心。

·1976年10月主持拱坝电子计算机分析会议，全力推进水工设计中电子计算机的应用和软件开发工作。

·1976年12月主持龙羊峡水电站审查会议，审定了坝址、坝型、规模（青海）。

·1977年1月出席风滩水电站审查会议（湖南）。凤滩水电站在建设过程中，临时改用空腹拱坝，遇到多重困难。潘家铮院士对于风滩工程曾给予有力支持，协助研究分析，提供用试载法分析空腹拱坝的方法，研究左岸边坡稳定问题等。凤滩水电站1978年投产后运行良好，效益显著。

·1977年3月主持设计规范审查会议。

·1977年6月审查云南黄泥河工程，决策开发鲁布草水电站（云南）。

·1977年6月出席葛洲坝二江工程审查会议（湖北）。

·1977年11月出席东江水电站初步设计审查会议（湖南）。东江水库库容达80亿m3，坝高150m，下游为京广线。地形地质条件优良，潘家铮院士在“文革”前就力主采用薄拱坝。审查会上，有些领导从稳妥考虑，且由于中国尚无建设如此高的薄拱坝经验，拟采用重力坝或厚拱坝。他深入分析，反复阐述，坚持推荐，使双曲拱坝方案终获通过。会后他协助中南院完善设计，解决许多问题。东江工程投产后，证明从设计到建设都是第一流水平。

·1977年12月出席风滩水电站鉴定会议，决策下闸蓄水；参与马迹塘工程研究（湖南）；出席陈村工程基础处理审定会议（安徽）。陈村工程拱坝基础内有不利的地质构造，影响安全，长期未能满蓄运行，拟在基础内进行开挖、回填混凝土处理，潘家体院主经慎重研究后指出，在水库已蓄水情况下进行地基内的开挖回填，不仅施工困难，而且弊大于利，建议改用高压灌浆和大口径钻孔回填方式处理，获得通过，为陈村水电站解决痼疾作出了贡献。

·1978年2月出席葛洲坝工程厂房设计审查会议（湖北）。

·1978年 3月～1985年 10月在水利电力部规划设计总院任副总工程师，后升任总工程师（该机构名称先后为：水利电力部规划设计院、电力工业部水电建设总局、水利电力部水利水电建设总公司、水利电力部水利水电规划设计院）。被授予部科技先进工作者称号。

·1978年7月审查铜街子工程和南桠河工程设计（四川）。

·1978年8月审查二滩水电站规划，决策采用一级开发方案，修建我国最高的拱坝（240m）（四川）。

1979年2月 赴日本考察高坝抗震技术，回来后推动高坝的动力分析、研究和试验工作。

1979年5月 主持铜街子工程初步设计审查、二滩选坝，选定高拱坝坝址（四川人1979年7月 与外国专家组考察二滩工程，高坝方案得到外国专家的充分肯定。

1979年8月 研究安康和五强溪工程技术问题（陕西、湖南）。

1979年9月 主持岩滩审查会、龙羊峡截流会（广西、青海）。

1979年10月 查勘黄河上游。

1979年12月 主持二滩工程中间讨论会，查勘四川水电资源（四川）。

1980年1月 研究鲁布革工

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