转向结核病病原菌研究。他改进染色方法,发现了当时未能得到的纯种结核杆菌。为了大量培养出纯种的结核菌,他又改用在凝固的血清上接种培养,并将培养出的纯种结核菌制成悬液,通过注射豚鼠的腹腔实验,4~6周后豚鼠即死于结核病。他用实验证明结核菌不论来自猴﹑牛或人均有相同症状。并进而阐明了结核病的传染途径。1882年3月24日结核杆菌是科赫在德国柏林生理学会上宣布结核杆菌是是结核病的病原菌。并研究出纯培养其菌的方法。1882年出版了有关结核杆菌的经典著作。1883年科赫被任命为德国霍乱委员会主席并。被派往埃及调查那里的霍乱暴发流行情况。
  1883年后,他到埃及和印度去调查那里的霍乱暴发流行情况。他和他的同事一起发现了霍乱病原菌是形如逗号的霍乱弧菌,并发现该菌可以经过水﹑食物﹑衣服等途径传播。根据他对霍乱弧菌的生物学知识以及其传播方式的了解,科赫提出控制霍乱流行的法则,这些法则于1893年被各大国批准并形成至今仍沿用的控制霍乱方法的基础。科赫因对霍乱研究作出的贡献而获10万德国马克奖金,他的这项研究工作也对保护饮水规划有重大影响。同时他还发现了阿米巴痢疾和两种结膜炎的病原体。1890年他提出用结核菌素治疗结核病。1891~1899年,他还在埃及﹑印度等地研究了鼠疫﹑疟疾﹑回归热﹑锥虫病和非洲海岸病等。1905年发表了控制结核病的论文,并获得诺贝尔生理学或医学奖。1910年5月27日因患心脏病卒于德国巴登。终年67岁。
  曾获奖项:
  1、1905年荣获生理学或医学诺贝尔奖海德堡大学及
  2、柏林市、Wottstein市及他的老家Ctausthal市均授予他名誉市民称号
  3、获柏林市、维也那等学术团体的名誉会员称号
  4、被授予德国的皇冠勋章
  5、被授予红鹰大十字勋章(为医学界第一位获此荣誉者)
  6、因对霍乱研究作出的贡献而获10万德国马克奖金
  7、博洛尼亚(Bologna)大学授予以他名誉博士学位
  8、德国政府于1907年为纪念他的成就,设了一笔100万马克的基金
  9、1897年被选为英国皇家学会会员
  10、1903年被选为法国科学院院士

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