吴敦义认为，特别费案是民进党设下“一个绵密的局”，从民进党团总召柯建铭数月前就直断马英九必遭起诉，到杂志在案件侦结前精准报道，都显示案件不能单纯从法律面看，马英九真的要小心，他认为马阵营不应拖延，但也不能进行太快，因为民进党就希望快，越快表示定罪率越高。