2006年7月孔令辉酒后驾车发生事故，幸而没有人员伤亡。孔令辉说，这件事是他驾驶生涯中最难忘的一件事，教训非常深刻。“这件事让我真正懂得尊重生命，生命是宝贵的，无论是自己的还是他人的。从那以后，我是开车绝不喝酒，喝酒了绝对不开车。”

不过孔令辉表示，这件事并没有给自己留下阴影，毕竟是运动员出身，心理素质比较好。在做人方面，孔令辉也有所感悟，他说：“那件事发生后，我把当初很招摇的保时捷跑车换成奥迪S8了。现在的车比较厚重，不招摇，这也符合我目前做教练的身份，做人还是低调些好。”